Основная образовательная программа лицея №410 включает несколько учебных планов различных профилей обучения:
- Технологический (инженерный) профиль. Ориентирован на производственную, инженерную и информационную сферы деятельности. В этом профиле на профильном уровне изучаются учебные предметы «Математика», «Физика», «Информатика».
- Естественнонаучный (медико-биологический) профиль. Ориентирован на такие сферы деятельности, как медицина, биотехнологии и другие. В данном профиле на углублённом уровне изучаются учебные предметы «Химия», «Биология» и курсы внеурочной деятельности преимущественно из предметных областей «Математика и информатика» и «Естественнонаучные предметы».
В лицее есть отделение дополнительного образования «Новая София». Оно реализует 24 программы по 6 направленностям:
- Художественная направленность: ИЗО-студия «Волшебная кисточка», основы черчения, дизайна и архитектуры, хоровая студия, театральная студия «КОТ», художественное рукоделие, эстрадно-танцевальная студия «ЮНиТА» (реализуется по двум направлениям: бальные танцы и хореография), вокально-эстрадная студия, «Этническая кукла» (традиционное русское рукоделие).
- Туристско-краеведческая направленность: туристический клуб «Лемминги».
- Социально-педагогическая направленность: «Софийская роза» (подготовка к мероприятиям лицея), клуб «Лидер» (поддержка и развитие лидерских качеств детей), школа дорожных наук.
- Техническая направленность: WEB-программирование, студия «Медиа».
- Естественно-научная направленность: «Увлекательная химия».
- Школьный спортивный клуб: секции баскетбол, волейбол, спортивное плавание, чир-лидинг.
Кроме того, в ноябре 2024 года на базе лицея №410 открылся математический кружок. Занятия по методике Президентского физико-математического лицея №239 будет вести выпускник этого лицея, победитель международных олимпиад по математике Алексей Новиков, а также учителя лицея.
